基于SCoT标记的饲用燕麦品种遗传结构及指纹图谱分析

• 作者: 李进 陈仕勇 赵旭 田浩琦 陈智华 周青平
• 来源期刊: 草业学报
• 关键词: 燕麦 SCoT 指纹图谱 遗传结构
• 年，卷（期）: 2021,（7）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 72-81
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.11686/cyxb2020596

摘要

采用目标起始密码子多态性标记(SCoT)对目前国内种植利用的36个饲用燕麦品种进行了遗传变异结构及指纹图谱分析.结果显示,从80个SCoT引物中筛选出多态性较好、条带清晰且重复性高的引物15个,共扩增出146条条带,不同引物扩增出的多态性条带数为3～9条,平均为6.4条,多态性比率为65.75％,平均有效等位基因数(Ne)为1.46,平均Nei's基因多样性指数为0.27,平均Shannon's多样性指数为0.38.基于4个多态性较高的核心引物组扩增的14个位点,构建了36个燕麦品种的DNA指纹图谱,其能够将供试燕麦品种区分并准确鉴定.供试品种的DICE遗传相似性系数为0.7596～0.9507,平均值为0.8473;基于遗传相似系数的非加权组平均法(UPGMA)聚类分析结果显示,可将36个品种分为四大类,聚类与其来源的关联性不高.群体遗传结构分析表明,国外引进品种遗传组成分布均匀,有32.1％的品种具有混合来源,而国内品种分布相对集中且仅有25.0％的品种有混合来源,表明供试的国内种植利用的燕麦品种遗传基础较狭窄,来源相对单一.结果为燕麦品种的鉴定、新品种的选育等提供了理论参考.