生物信息学方法鉴定与肾透明细胞癌预后相关的关键基因

• 作者: 何天基 陈翔 王伟 刘峰 蔡孟会 石海林
• 来源期刊: 癌症进展
• 关键词: 肾透明细胞癌 生物信息学 关键基因 肿瘤基因图谱 基因表达汇编
• 年，卷（期）: 2021,（11）
• 所属期刊栏目: 论著|Originals
• 页码范围: 1109-1114
• 页数: 6页
• 分类号: R737.11
• 语种: 中文
• DOI: 10.11877/j.issn.1672-1535.2021.19.11.07

摘要

目的 采用生物信息学方法鉴定与肾透明细胞癌(KIRC)预后相关的关键基因,并进一步分析其临床意义.方法 通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)获取肿瘤基因组图谱(TCGA)和基因表达汇编(GEO)中KIRC的基因表达谱数据,提取与正常肾组织差异表达的关键基因,结合TCGA数据库中的生存时间进行预后分析.结果 在TCGA和GEO数据库中共分析得到112个重叠基因,鉴定出10个KIRC关键基因(RAB25、ESRP1、EPCAM、VEGFA、MAL2、GRHL2、AP1M2、GPC3、CP、OCLN),OCLN高表达患者的总生存期(OS)长于OCLN低表达患者,而GPC3、RAB25及GRHL2低表达患者的OS分别长于GPC3、RAB25及GRHL2高表达的患者,差异均有统计学意义(P﹤0.05);OLCN及MAL2高表达患者的无病生存期(DFS)分别长于OLCN及MAL2低表达患者,GPC3及CP低表达患者的DFS分别长于GPC3及CP高表达患者,差异均有统计学意义(P﹤0.05).结论 本研究采用生物信息学方法鉴定出了与KIRC预后相关的关键基因,其中OCLN、RAB25、GRHL2及GPC3与KIRC患者的OS有关,而OLCN、GPC3、CP及MAL2与KIRC患者的DFS有关,这可能成为未来恶性肿瘤治疗的新靶点.