两种烟曲霉基因分型方法的比较研究

• 作者: 申红卫 李成林 马雯 周义文
• 来源期刊: 热带医学杂志
• 关键词: 烟曲霉 基因分型 短串联重复序列
• 年，卷（期）: 2021,（6）
• 所属期刊栏目: 实验研究论著|Experiment Research
• 页码范围: 691-694,734
• 页数: 5页
• 分类号: R379.6
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-3619.2021.06.005

摘要

目的 筛选一种操作简单、分辨率高的烟曲霉基因分型方法.方法 选取分离自14例慢性肺曲霉病(CPA)患者的31株烟曲霉,同时用两种基于串联重复序列[改良烟曲霉短串联重复序列(改良STRAf)和表面蛋白编码基因外显子的串联重复序列(TRESP)]的方法进行基因分型,用NCSS 11软件绘制树状图,比较两种方法的分型效果.结果 改良STRAf方法共鉴定出23种基因型,其中MC3是分辨率最高的基因,共鉴定出14个等位基因;TRESP方法共鉴定出18种基因型,MP2、CSP、CFEM最常见的基因型分别为m1.1、t03、c08A,其中MP2是分辨率最高的基因,共鉴定出8个等位基因;菌株11、13的改良STRAf分型结果一致,但CSP基因存在一个短串联重复序列(STR)差别;菌株23与M患者分离菌株的TRESP分型一致,但其改良STRAf方法多个基因的STR数存在差别.结论 TRESP的分辨率略低于改良STRAf方法,但其不依赖于仪器,适合在临床实验室推广使用.