基于SSR分子标记的68份柚类种质资源亲缘关系分析

• 作者: 王旭 彭洁 朱延松 杨胜男 张晓楠 余洪 江东 梁大成
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 柚 SSR分子标记 亲缘关系
• 年，卷（期）: 2021,（4）
• 所属期刊栏目: 动物科学·生物技术
• 页码范围: 100-103,130
• 页数: 5页
• 分类号: Q943
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0517-6611.2021.04.027

摘要

[目的]用17对SSR引物对68份柚类种质资源进行遗传背景研究,推演其亲缘关系,为更好地利用这68份材料提供参考.[方法]17对SSR引物进行PCR扩增;用Power Marker V3.25软件计算观测等位变异数(Na)、有效等位变异数(Ne)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、香农多样性指数(I)和引物多态信息含量(PIC);用Ntsys2.0计算材料间的遗传距离并进行聚类;用Structure2.3.4推导群体遗传结构.[结果]17对引物扩增出62条多态性条带,平均为3.6470条.计算得出这62个多态性标记位点的平均等位变异数Na为3.4706,平均有效等位变异数Ne为2.1523,平均观测杂合度Ho为0.4542.平均期望杂合度He和香农多样性指数I分别为0.4810和0.8482,多态信息含量(PIC)平均值为0.4198.在遗传距离0.36处将材料分成5个类群,结构分析中将材料分成4个组群,聚类分析和结构分析结果基本一致.[结论]所选材料具有丰富的遗传多样性,聚类和结构分析的结果能直观地了解这68份材料的亲缘关系,并对其中可能的同物异名品种进行筛选.