芽孢杆菌LM基于全基因组的分类鉴定及抑菌原理的研究

• 作者: 蔡国磊 陆小凯 娄水珠 杨海英 杜刚
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 解淀粉芽孢杆菌 抑菌活性 基因组 次级代谢基因簇 超高效液相色谱质谱
• 年，卷（期）: 2021,（8）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 176-185
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2020-1303

摘要

对一株抗黑曲霉活性的芽孢杆菌进行了基因组和超高效液相色谱质谱(UPLC-Q-TOF-MS)分析研究.结合形态特征、16S rRNA序列和gyrA基因聚类分析,初步鉴定菌株为解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens);全基因组分析表明菌株基因组大小为4000885 bp,GC含量为46.24％;antiSMASH分析表明基因组中含11个次级代谢产物基因簇,大多编码抗菌物质;UPLC-Q-TOF-MS分析发现10个化合物的分子量与antiSMASH预测的3个基因簇编码的化合物分子量相同,为表面活性素(surfactin)、伊枯草菌素(iturin)和芬荠素(fengycin)等脂肽类抗生素同系物,推测解淀粉芽孢杆菌的抗黑曲霉活性与这3类物质有关.