辣椒miR169及其靶基因的生物信息学分析

• 作者: 刘雪梅 王悦 李玮琦 魏继承 任如意 郝爱平
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: miR169 辣椒 生物信息学 NF-YA
• 年，卷（期）: 2021,（6）
• 所属期刊栏目: 园艺|HORTICULTURE
• 页码范围: 1510-1515
• 页数: 6页
• 分类号: S641.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2021.06.020

摘要

为了解miR169基因家族在辣椒生长发育过程的重要调控作用,通过生物信息学的方法对can-miR169基因家族的成员进行了染色体定位、序列保守性分析、系统发育进化树分析、前体序列二级结构预测和靶基因预测.结果表明:can-miR169家族成员定位在4条染色体上;成熟序列高度保守,前体序列在产生成熟序列的位置高度保守;预测结果显示can-miR169家族成员均有靶基因,这些靶基因主要以靶基因核因子A(NF-YA)复合物为主,且大体相同.这些靶基因可以参与到种子萌发、植株发育和对外界环境胁迫的应答等多种生命活动中.