猪GV/MⅡ期卵母细胞miRNAs表达谱及Npm2基因相关miRNAs筛选

• 作者: 张珂 严继猛 刘耀文 李鸿辉 陈强 李卓 苏艳华 普少瑕 王海臻 魏红江 贾宝瑜 成文敏
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 关键词: 猪 卵母细胞 miRNAs Npm2基因
• 年，卷（期）: 2021,（4）
• 所属期刊栏目: 生物技术与繁殖|ANIMAL BIOTECHNOLOGY AND REPRODUCTION
• 页码范围: 996-1009
• 页数: 14页
• 分类号: S828.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2021.04.015

摘要

旨在探索体外成熟前后猪卵母细胞miRNAs表达谱,并筛选参与调控Npm2基因表达的miRNAs.本试验回收屠宰场猪卵巢,收集GV期卵母细胞,经体外成熟培养后获得MⅡ期卵母细胞,分别提取约130个GV期和MⅡ期卵母细胞总RNA进行Illumina HiSeqTM 2500测序,获取miRNA测序数据,每个处理重复3次,筛选差异表达microRNAs并进行靶基因GO和KEGG聚类分析.结果表明,本研究成功构建了GV期和MⅡ期猪卵母细胞miRNAs表达谱,GV期和MⅡ期卵母细胞差异表达miRNAs有95个,具有相似表达模式的miRNA聚为一类,对95个差异表达miRNAs进行靶基因预测,共得到3967个靶基因,经GO和KEGG富集分析表明,这些靶基因被富集于5194个GO条目和212个信号通路,其中参与卵母细胞减数分裂成熟的信号通路有2个.在差异表达miRNAs中筛选到5个与Npm2基因相关的miRNAs.采用qRT-PCR对其中2个miRNAs进行验证,证实其表达趋势与测序结果一致.本研究筛选了GV期和MⅡ期卵母细胞差异表达miRNAs,推测差异表达的miRNAs可能通过代谢、卵母细胞减数分裂相关通路、孕激素介导的卵母细胞成熟通路等途径在卵母细胞体外成熟过程中发挥作用,并筛选出调控Npm2基因表达的miRNAs,研究结果可为进一步阐明miRNA对Npm2基因的调控及其在卵母细胞成熟过程中的作用提供依据.