抑郁症小鼠海马组织差异表达炎症因子基因筛选及生物信息学分析

• 作者: 邵青 袁东亮 王娜 阎得胜 张晓红 张辉 权伟
• 来源期刊: 山东医药
• 关键词: 抑郁症 海马组织 炎症因子 基因芯片 生物信息学
• 年，卷（期）: 2021,（8）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 42-45
• 页数: 4页
• 分类号: R749.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-266X.2021.08.010

摘要

目的 筛选抑郁症小鼠海马组织中差异表达的炎症因子基因,并进行生物信息学分析.方法 将12只C57小鼠分为对照组和抑郁症组,每组6只.抑郁症组通过慢性不可预知温和应激模型制备小鼠抑郁症模型,对照组不造模.取两组海马组织,采用实时定量PCR检测84个炎症因子基因.采用GeneSpring GX11.5.1软件分析基因芯片数据,获取两样本信号强度比值(Ratio),将Ratio>2或<0.5作为有表达差异,Volcano Plot筛选差异表达基因.对差异表达基因进行GO生物过程(GO-BP)富集分析和KEGG通路分析.通过对GO-BP分析及KEGG通路分析结果进行交集,筛选目标差异表达基因.结果 与对照组相比,抑郁症组中差异表达的细胞因子基因有6个,表达上调的3个基因分别为CXCL5、BMP2、IL10RA,表达下调的3个基因分别为CCL12、IL5、IL1A.差异表达基因主要参与白细胞迁移、白细胞趋化性及免疫系统过程等生物过程的调控,参与细胞因子与细胞因子受体相互作用通路、趋化因子信号转导通路及IL-17信号转导通路等.共筛选出4个目标差异基因,为CXCL5、BMP2、IL1A、CCL12基因.结论 抑郁症小鼠海马组织中差异表达的炎症因子基因主要为CXCL5、BMP2、IL1A、CCL12等,这些炎症因子基因可能通过调控多种生物过程和多条信号通路参与抑郁症的发病.