基于加权共表达网络预测结直肠癌的核心基因

• 作者: 兰燕 张旭
• 来源期刊: 重庆理工大学学报（自然科学版）
• 关键词: 结直肠癌 核心基因 加权共表达网络 功能富集分析 生存分析
• 年，卷（期）: 2021,（3）
• 所属期刊栏目: 数学·统计学
• 页码范围: 242-251
• 页数: 10页
• 分类号: R965.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-8425(z).2021.03.032

摘要

研究根据GE O数据库下载的包括17对结直肠癌组织和正常组织的基因芯片数据集GSE32323,对方差前25％的基因进行加权共表达网络分析得到10个模块,然后利用P<0.05选出与结直肠癌显著最相关的2个模块,用DAVID数据库对其进行GO和KEGG富集分析,表明这2个模块主要富集在细胞调控、细胞外泌体、代谢通路和细胞分裂、蛋白结合、细胞周期、P53信号通路等过程.再用Cytoscape对核心模块可视化,根据GEPIA数据库作生存分析,由P<0.05得到PPARG,ACO2,MYC,CCNB2和NUP37共5个核心基因作为结直肠癌可能的生物标志物,为结直肠癌治疗药物靶点的选取奠定了理论基础.