结肠腺癌APC2基因表达及预后的生物信息学分析

• 作者: 胡明超 王强 吴嘉旭 俞文渊
• 来源期刊: 临床检验杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 结肠癌 腺瘤性结肠息肉病基因2 生物信息学 预后
• 年，卷（期）: 2021,（12）
• 所属期刊栏目: 循证医学
• 页码范围: 941-944
• 页数: 4页
• 分类号: R446
• 语种: 中文
• DOI: 10.13602/j.cnki.jcls.2021.12.14

摘要

目的 基于癌症基因图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库分析腺瘤性结肠息肉病基因(adenomatous polyposis coli 2,APC2)的表达水平,评估其在结肠癌患者中的诊断及预后价值.方法 从TCGA数据库中下载所有结肠腺癌(colon ad-enocarcinoma,COAD)患者APC2基因的RNA-Seq转录组数据以及对应的每例患者的临床参数,分析APC2基因的表达水平与COAD患者临床病理参数以及预后的关系,并利用String在线分析工具寻找与APC2蛋白相互作用的蛋白质网络.结果 APC2基因在COAD患者癌组织中的表达量低于癌旁组织(0.87±0.42 vs 1.11±0.22,t=3.58,P<0.05);ROC曲线显示,APC2基因对COAD具有良好的诊断价值(AUCROC=0.7391,95％CI:0.6855～0.7926,P<0.0001);APC2基因的表达与COAD患者的淋巴结转移、TNM分期以及最终生存结局密切相关(P<0.05);APC2基因低表达COAD患者的总体生存时间显著长于APC2基因高表达者(P<0.05);蛋白质网络风险结果显示,CDC16、CDC23、CDC27、ANAPC15可与APC2蛋白相互作用,主要参与生物学过程中的有丝分裂调节,蛋白质连接的泛素化,蛋白质复合物依赖的分解代谢等过程.结论 APC2基因在COAD癌组织中表达下调,并与疾病的进展以及预后密切相关,有潜力成为结肠癌诊断、预后评估以及靶向治疗的新型生物学标志物.