钩藤光敏色素互作因子鉴定及其表达分析

• 作者: 王晓红 郑浩杰 李雪 强玮 于晓松 上官黎阳 张明生
• 来源期刊: 植物生理学报
• 关键词: 钩藤 光敏色素互作因子 遮光 系统进化分析 基因表达
• 年，卷（期）: 2021,（11）
• 所属期刊栏目: 研究报告|Original Papers
• 页码范围: 2104-2116
• 页数: 13页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13592/j.cnki.ppj.2021.0188

摘要

光敏色素互作因子(phytochrome-interacting factors,PIFs)是具有基本螺旋-环-螺旋(bHLH)结构域的转录因子,它们与光敏色素相互作用,在光信号转导过程发挥重要作用.基于转录组数据注释及蛋白同源比对,共筛选出28个钩藤PIF家族成员(UrPIFs),编码蛋白的长度在420～741个氨基酸之间,理论分子量46.47～79.46 kDa;等电点5.97～9.15.亚细胞定位预测结果显示UrPIFs均位于细胞核.系统进化关系和保守基序分析表明,28个UrPIFs分为4组,都具有活性光敏色素B结合(active phytochrome B-binding,APB)结构域和bHLH结构域,而且每组成员之间具有相似的保守基序.组织表达谱显示多数UrPIFs在叶中表达量较高,其次是茎,最低的是根.在遮光条件下,除UrPIF05外,7个UrPIFs表达量呈上升趋势;转移至正常光照条件后,8个UrPIFs的表达量均呈下降趋势.尤其是UrPIF15对光较为敏感,可能在光信号转导中发挥重要作用.UrPIFs的鉴定和分析可为进一步构建钩藤光调控网络提供参考.