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基于生物信息学分析LPAR5在甲状腺乳头状癌中的表达及其意义
基于生物信息学分析LPAR5在甲状腺乳头状癌中的表达及其意义
作者:
李娜
连续
兰宏伟
许红昕
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
甲状腺乳头状癌
LPAR5
生物信息学
GEO
TCGA
GEPIA2
摘要:
目的 通过生物信息学的方法分析溶血磷脂酸受体5(LPAR5)在甲状腺乳头状癌(PTC)中的表达及临床意义,为PTC分子生物研究和生物标志物筛选提供理论依据.方法 2020年5月开始从GEO数据库中筛选数据,最终筛选出编号为GSE3678的基因芯片,并对样本进行规范化处理,筛选出差异表达基因LPAR5.利用TCGA数据库验证LPAR5在甲状腺癌组织和正常甲状腺组织差异表达情况,同时在ulcan数据库分析LPAR5表达与PTC患者临床特征之间的关系.通过GEPⅠA2分析LPAR5基因与甲状腺癌生存率之间的关系.结果 共筛选出甲状腺癌差异基因755个,其中表达上调差异基因314个,表达下调差异基因441个,基于TCGA基因表达数据分析得出LPAR5在甲状腺癌中表达高于正常甲状腺组织,LPAR5表达量与甲状腺癌患者的临床分期和N分期密切相关(P<0.05),而与性别、年龄未见相关性(P>0.05),GEPⅠA2分析显示甲状腺癌患者LPAR5高表达组总生存率高于低表达组(P<0.05),而在甲状腺癌患者无病生存期中LPAR5高表达组与低表达组比较,差异无统计学意义(P>0.05).结论 本研究通过生物信息学分析得到了甲状腺癌中的部分差异基因,并通过TCGA数据库分析进一步验证了LPAR5在甲状腺癌中的高表达,且与肿瘤临床分期和N分期密切相关,进一步证明了LPAR5可能参与PTC的发生发展,并影响PTC淋巴结转移.
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篇名
基于生物信息学分析LPAR5在甲状腺乳头状癌中的表达及其意义
来源期刊
中国现代医生
学科
关键词
甲状腺乳头状癌
LPAR5
生物信息学
GEO
TCGA
GEPIA2
年,卷(期)
2021,(9)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
1-4,9,封3
页数
6页
分类号
R736.1
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甲状腺乳头状癌
LPAR5
生物信息学
GEO
TCGA
GEPIA2
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研究来源
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中国现代医生
主办单位:
中国医学科学院
出版周期:
旬刊
ISSN:
1673-9701
CN:
11-5603/R
开本:
大16开
出版地:
北京市朝阳区东四环中路78号楼(大成国际中心B座)708-3室
邮发代号:
80-611
创刊时间:
2007
语种:
chi
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34652
总下载数(次)
12
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