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铁皮石斛蛋白磷酸酶PP2C家族基因鉴定及其表达分析
铁皮石斛蛋白磷酸酶PP2C家族基因鉴定及其表达分析
作者:
张婷婷
李雨欣
张德遥
康宇乾
王健
宋希强
周扬
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
铁皮石斛
蛋白磷酸酶PP2C
非生物胁迫
植物生长调节剂
表达分析
摘要:
利用生物信息学方法对铁皮石斛(Dendrobium catenatum Lindl.)2C型蛋白磷酸酶(protein phosphatase 2C,PP2C)家族基因进行鉴定分析,采用实时荧光定量PCR技术分析PP2C基因的组织表达特性,以及在不同非生物胁迫和植物生长调节剂处理下的表达模式.共鉴定出67个家族成员,其编码的氨基酸在80~1075aa之间,分子量在8.86 ~ 119.59kD之间,等电点在4.13~9.36之间.进化树分析可将其分为13个亚族,且每个亚族蛋白的保守基元相似.基因结构分析表明,PP2C基因的外显子数量为l~15不等.空间表达模式分析发现有4个PP2C在铁皮石斛合蕊柱中表达量最高,5个基因在蒴果中表达量最高,有1个基因在根中表达量最高,PP2C的表达具有组织特异性.DcPP2C5、DcPP2C20和DcPP2C56表达量受干旱胁迫(20% PEG6000)上调较明显,DcPP2C24受高温(42℃)诱导最显著,DcPP2C5受低温(4℃)诱导上调表达,DcPP2C20受到盐胁迫(200 mmol.L-1 NaCl)诱导,这些基因的表达均在不同程度上受100 μmol· L-1ABA和20μmol· L-1 SA的诱导,说明它们在铁皮石斛应对逆境胁迫中发挥作用.
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文献信息
篇名
铁皮石斛蛋白磷酸酶PP2C家族基因鉴定及其表达分析
来源期刊
园艺学报
学科
农学
关键词
铁皮石斛
蛋白磷酸酶PP2C
非生物胁迫
植物生长调节剂
表达分析
年,卷(期)
2021,(12)
所属期刊栏目
研究论文|Research Papars
研究方向
页码范围
2458-2470
页数
13页
分类号
S567
字数
语种
中文
DOI
10.16420/j.issn.0513-353x.2021-0382
五维指标
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
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引文网络
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(0)
共引文献
(0)
参考文献
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2021(0)
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研究主题发展历程
节点文献
铁皮石斛
蛋白磷酸酶PP2C
非生物胁迫
植物生长调节剂
表达分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
园艺学报
主办单位:
中国园艺学会
中国农业科学院蔬菜花卉研究所
出版周期:
月刊
ISSN:
0513-353X
CN:
11-1924/S
开本:
大16开
出版地:
北京中关村南大街12号
邮发代号:
82-471
创刊时间:
1962
语种:
chi
出版文献量(篇)
6617
总下载数(次)
13
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