基于GEO数据挖掘与网络药理学探讨化痰通络汤治疗脑梗死的机制研究

• 作者: 龚翠兰 周德生 杨仁义 傅馨莹
• 来源期刊: 世界中医药
• 关键词: 基因表达综合 差异基因 化痰通络汤 脑梗死 网络药理学 风痰阻络证 KE GG富集分析 靶点
• 年，卷（期）: 2021,（9）
• 所属期刊栏目: 中药研究|Chinese Pharmacy
• 页码范围: 1406-1412
• 页数: 7页
• 分类号: R255.2|R743.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-7202.2021.09.010

摘要

目的:采用GE O芯片数据及网络药理学方法,分析脑梗死疾病基因,并对化痰通络汤治疗脑梗死风痰阻络证的作用机制进行探讨,为脑梗死的中医药防治提供理论依据.方法:采用多学科交叉方法对化痰通络汤治疗脑梗死风痰阻络证进行研究,整合GEO、GeneCards、TCMSP、PubChem、Swiss Target Prediction、String、WebGestalt数据库资源,利用Cytoscape、R语言软件,对脑梗死差异基因、疾病靶点、化痰通络汤的中药有效成分、中药靶点进行筛选,从蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)共表达网络、GO及KEGG富集分析角度,探讨化痰通络汤治疗脑梗死风痰阻络证的所用机制.结果:获取3110个脑梗死疾病靶点,其中203个差异基因,198个在脑梗死疾病中表达上调,5个在脑梗死疾病中表达下调,可作为诊断及治疗的潜在靶点.PPI网络及Degree、Betweenness、Closeness算法拓扑分析结果显示,PI3KCA、MAPK1、EGFR等48个靶点相互作用最强,可作为后续基础研究验证方向.GO、KEGG富集分析结果显示,BP共富集354个生物进程,CC共富集16个细胞组分,MF共富集29个分子功能,KEGG共富集137个信号通路,结合FDR、ratio与P值结果对富集分析结果进行权重分析,进一步聚焦其富集结果.结论:化痰通络汤可针对性上调GFAP、CD14、STAT3、H19、CXCL16等,下调NAT8F3、OLR59、GPR88等,以多组分、多功能、多途径的形式介导鞘脂信号通路、VEGF通路、HIF-1通路等多通路在脑梗死风痰阻络证中发挥作用.