番茄MYB44基因生物信息学及亚细胞定位分析

• 作者: 李颖 王莹莹 苏旭 谷建田
• 来源期刊: 中国农学通报
• 关键词: 番茄 基因 SlMYB44 生物信息学分析 亚细胞定位 低温胁迫
• 年，卷（期）: 2021,（14）
• 所属期刊栏目: 生物科学
• 页码范围: 34-40
• 页数: 7页
• 分类号: S641.2
• 语种: 中文

摘要

旨在分析SlMYB44基因的生物学功能,为其抗冷害作用机制提供科学依据.本文以俄罗斯栽培番茄Bolgogragsky为材料,根据转录组测序结果,筛选出差异表达基因SlMYB44作为研究对象.运用多种生物信息学数据库分析了番茄SlMYB44基因的保守结构域、亲疏水性、信号肽以及启动子顺式作用元件.并且构建了pMDC43-MYB44表达载体进行亚细胞定位分析.结果 表明SlMYB44基因全长1551 bp,共372个氨基酸.S1MYB44蛋白没有潜在的信号肽和跨膜结构,属于不稳定、亲水性蛋白.SlMYB44基因启动子顺式作用元件分析发现,大部分与逆境胁迫、激素响应等相关.亚细胞定位分析发现SlMYB44基因表达产物定位于细胞核中.SlMYB44基因对番茄冷害有响应,进一步推测其可能影响番茄御冷机制.