46例前列腺癌患者的组织DNA及血液ctDNA测序分析

• 作者: 唐堂 唐朋 谭信韬 冉强 彭松 刘秋礼 徐静 江军
• 来源期刊: 第三军医大学学报
• 关键词: 前列腺癌 二代测序 全外显子测序 基因突变 同源重组基因
• 年，卷（期）: 2021,（17）
• 所属期刊栏目: 基础医学|Basic Medicine
• 页码范围: 1658-1666,封3
• 页数: 10页
• 分类号: R394.3|R730.43|R737.25
• 语种: 中文
• DOI: 10.16016/j.1000-5404.202104084

摘要

目的 探讨前列腺癌患者组织DNA与血液ctDNA检出的突变情况,分析基因突变与临床特点和治疗的相关性.方法 采用探针杂交捕获和Illumina高通量测序为基础的靶向二代测序技术检测本院泌尿外科46例病理诊断明确的前列腺癌患者的前列腺组织标本(n=31)以及外周血液标本(n=32)循环肿瘤细胞DNA(circulating tumor DNA,ctDNA)的突变情况,检测范围包括1021个基因的全外显子区域及部分内含子区域中的4种突变类型(点突变、小片段的插入缺失、拷贝数变异和目前已知的融合基因).结果 在31例患者的前列腺组织标本中最常被检出的突变基因为TP53(29％,9/31),其次为CDK12(22.6％,7/31)、FOXA1(22.6％,7/31)与JAK1(16.1％,5/31).在32例外周血ctDNA标本中检测出的常见突变基因为AR(34.3％,11/32)、APC(25％,8/32)、CDK12(18.8％,6/32)、DNMT3a(18.8％,6/32)与TP53(18.8％,6/32).TMPRSS2-ERG融合基因在所有检测患者中检出率为13％(6/46).其中1例患者同时存在TMPRSS2-ERG、VEGFA-TMPRSS2及ERG-VEGFA融合突变.46例患者中同源重组相关基因的体细胞突变检出率为21.7％,携带有胚系同源重组基因突变患者占8.7％.且携带(无论胚系或体细胞)同源重组基因突变患者的发病年龄更低、Gleason评分更高、转移灶数量更多,特别是携带胚系突变的患者更显著.结论 血液ctDNA和传统的组织DNA样本均可检出基因突变;血液ctDNA检测可动态监控前列腺癌基因频谱在治疗过程中的变化,有助于及时调整治疗方案.