基于高通量基因表达数据库开发骨肉瘤预后相关的微小RNA研究

• 作者: 李矛 白玉龙 迟成 唐家广 周建伟
• 来源期刊: 北京医学
• 关键词: 骨肉瘤 高通量基因表达数据库 微小RNA 分子标志物
• 年，卷（期）: 2021,（10）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 974-979
• 页数: 6页
• 语种: 中文
• DOI: 10.15932/j.0253-9713.2021.10.009

摘要

目的 筛选骨肉瘤失调微小RNA(microRNA),构建多基因预后模型,探索骨肉瘤的关键microRNA治疗靶标.方法 通过高通量基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)中的GSE28423数据集,筛选相对于癌旁正常组织和骨肉瘤组织中的差异microRNA,并利用GSE39040数据集中的临床信息,分析这些差异microRNA对预后生存的影响;对关键microRNA的靶基因进行功能富集,探索关键microRNA的功能,构建基于关键microRNA的预后预测模型.结果 共获得共166个差异microRNA,其中70个下调,96个上调(P＜0.05),其中有3个microRNA对患者的总体生存率以及预后有显著影响(P＜0.05),分别是hsa-miR-1、hsa-miR-153和hsa-miR-487b.构建由hsa-miR-1、hsa-miR-153和hsa-miR-487b共同组成的预后预测模型,ROC结果显示该模型具有良好的预后预测性能(AUC=0.8428,95％CI:0.7417～0.9439,P＜0.0001);功能富集分析也提示,hsa-miR-1、hsa-miR-153和hsa-miR-487b所调控的靶基因,富集于细胞增殖、凋亡和上皮间充质转化等多个与肿瘤相关的功能(P＜0.05).结论 has-miR-1、has-miR-153和has-miR-487b可能在骨肉瘤的发生发展过程中发挥重要作用,并有望成为骨肉瘤生物分子标志物及治疗靶点.