中华绒螯蟹养殖池塘菌群结构和功能特征

• 作者: 许郑超 邓燕飞 周军 李旭光 陆全平 陈风蔚 周刚
• 来源期刊: 生态学杂志
• 关键词: 中华绒螯蟹 16S rDNA 菌群结构 环境因子 Tax4Fun
• 年，卷（期）: 2021,（7）
• 页码范围: 2223-2233
• 页数: 11页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13292/j.1000-4890.202107.031

摘要

通过Hiseq高通量测序方法分析了中华绒螯蟹(Eriocheir sisensis L.)养殖池塘和外源河水体的微生物群落结构、功能特征以及与环境因子的关系.结果表明:养殖池水体的6个样本,共得到有效序列541349条,可归纳为2938个OTU;外源河水体的6个样本,共得到有效序列551891条,可归纳为2779个OTU;池塘沉积物的6个样本,共得到有效序列557736条,可归纳为8920个OTU.α-多样性分析表明,养殖池沉积物的Sobs指数、Shannon指数、Simpson指数、Chao指数均显著高于水体样本;β-多样性分析表明,各样本菌群按照菌群结构可以分为两大类,既沉积物组和水体组;在养殖池和外源河水体中,门水平的优势菌群主要有变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、蓝细菌门(Cyanobacteria)、疣微菌门(Verrucomicrobia)、浮霉菌门(Planctomycetes)、拟杆菌门(Bacteroidetes);在养殖池沉积物中,门水平的优势菌群主要有变形菌门(Proteobacteria)、浮霉菌门(Planctomyce-tes)、酸杆菌门(Acidobacteria)、疣微菌门(Verrucomicrobia)、绿弯菌门(Chloroflexi)、拟杆菌门(Bacteroidetes).冗余分析表明,温度(r2 = 0.915,P＜0.01)、pH(r2 = 0.8,P＜0.01)、溶氧量(r2 = 0.65,P＜0.0l)、水质总硬度(r2 = 0.756,P＜0.01)与菌群结构呈极显著相关,NH3-N、NO2--N、COD、N(3--N、TP、TN与菌群结构无显著相关性.方差分解分析表明,在门水平对水体菌群分布贡献度较大的环境因子为pH、温度和溶氧量,贡献度分别为44.14％、41.20％和33.2％.Tax4Fun对各样本的菌群进行基因功能预测表明,在level 2水平下共得到37个预测功能,水体和沉积物中主要优势功能均为碳水化合物代谢、氨基酸代谢.沉积物菌群中氨基酸代谢、脂类代谢、膜转运、外源性生物降解和代谢的功能基因丰度显著低于养殖水体,能量代谢、多糖生物合成和代谢的功能基因丰度显著高于养殖水体.研究结果为河蟹养殖环境调控和生态环境保护提供了科学基础.