乳胶清除蛋白LcpK30催化氧气裂解聚顺-1,4异戊二烯机理

• 作者: 吴鹏 陈倩倩 王斌举
• 来源期刊: 科学通报
• 关键词: 乳胶清除蛋白 催化 量子力学/分子力学组合方法 反应机理 橡胶降解 血红素酶
• 年，卷（期）: 2021,（22）
• 所属期刊栏目: 论文
• 页码范围: 2887-2897
• 页数: 11页
• 语种: 中文
• DOI: 10.1360/TB-2020-1299

摘要

乳胶清除蛋白LcpK30是一种内型双加氧酶,其通过活化分子氧催化裂解化学惰性的聚顺-1,4异戊二烯,进而生成醛和酮.实验发现活性区域的谷氨酸148对活性有重大影响,然而其作用机制和整个反应机理仍然存在争议.本研究使用量子力学/分子力学组合方法研究了乳胶清除蛋白催化分子氧氧化裂解天然橡胶模型化合物的反应机理.计算结果显示谷氨酸148在反应过程中为质子化态,并与铁(Ⅲ)-超氧物种形成稳定氢键,因此其作用可能与调节铁(Ⅲ)-超氧物种与底物的位置有关.可能反应机理为:(1)铁(Ⅲ)-超氧物种的远端氧进攻底物碳碳双键,形成过氧烃自由基中间体;(2)近端氧回弹到碳自由基,形成过氧化物中间体和铁(Ⅱ)中心;(3)铁(Ⅱ)调节的过氧化物中间体O-O键还原裂解,生成邻二醇自由基负离子中间体;(4)邻二醇自由基负离子C-C键断裂,生成产物醛和酮.此外,计算发现,过氧化物中间体O-O键直接断裂反应能垒超过160 kJ/mol,表明铁(Ⅱ)的催化对于过氧化物中间体的后续转化至关重要.因此,本研究结果不仅加深对于LcpK30反应机理的理解,而且为Lcp酶降解合成橡胶材料的设计和工程化提供有用信息.