血瘀体质中lncRNA和mRNA表达谱分析及调控网络研究

• 作者: 董丽丹 李玲孺 张妍 成金俊 郑燕飞 王琦
• 来源期刊: 世界中医药
• 关键词: 长链非编码RNA 血瘀体质 生物信息学 中医
• 年，卷（期）: 2021,（8）
• 所属期刊栏目: 思路与方法|Thought &Method
• 页码范围: 1311-1315
• 页数: 5页
• 分类号: R21|R229
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-7202.2021.08.024

摘要

目的:为了更客观地探索血瘀体质的微观特征,本研究从转录组学水平首次初步揭示血瘀体质外周血中lncRNA和mRNA的表达谱特征及其相关作用网络.方法:运用Agilent Human lncRNA+mRNA 4×180 k表达谱芯片,从血瘀体质(BSC,n=11)和平和体质(BC,n=9)者的外周血中分离单个核细胞(Peripheral Blood Mononuclear Cells,PBMCs),采用"limma"方法筛选出2组差异有统计学意义的lncRNAs和mRNAs,对差异基因进行GO功能和KEGG信号通路的显著性富集分析,通过构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图并寻找其作用通路中关键的hub基因.结果:差异表达的lncRNAs和mRNAs均能够将血瘀体质和平和体质进行区分.血瘀体质中差异有统计学意义的lncRNAs 394个(139个上调,255个下调)和mRNAs 410个(159个上调,251个下调).结果 显示,血瘀体质差异基因显著聚集在生长发育调节和细胞信号传导相关作用通路,例如,MAP激酶活性的正向调控、血管生成的正向调控、腺苷酸环化酶活性的激活、卵巢卵泡发育、γ-氨基丁酸能突触以及PI3K-AKT信号通路等.通过构建PPI并筛选了一些核心基因,如,FGF2、VEGFA、HIST1H2BK和PHF5 A等.结论:血瘀体质易感冠心病,脑卒中等循环系统疾病和疼痛性疾病等物质基础可能与lncRNAs/mRNAs的生长发育调节和细胞信号传导失调相关.