福建西南地区华溪蟹属种群DNA条形码分析

• 作者: 蔡茂荣 白俊 程由注 罗鋆 许姝歆 林国华 黄明松 陈锦钟 邹节新
• 来源期刊: 热带医学杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 华溪蟹属 CO1基因 DNA条形码 福建西南地区
• 年，卷（期）: 2021,（12）
• 所属期刊栏目: 实验研究论著|Experiment Research
• 页码范围: 1497-1501,1508,封2
• 页数: 7页
• 分类号: Q959
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-3619.2021.12.001

摘要

目的 采用DNA条形码分析福建西南地区华溪蟹属物种及其地域种群的特征,并验证分子鉴定对形态学分类的有效性.方法 在福建西南部龙海市程溪等10地采集华溪蟹标本,进行形态学分类鉴定.选择线粒体细胞色素氧化酶1(CO1)基因片段作为DNA条形码,经PCR扩增、测序后获取目的 序列数据,结合GenBank数据库中相关序列数据,构建系统发生树.结果 获得的华溪蟹属下平和华溪蟹、将乐华溪蟹、漳州华溪蟹和福建华溪蟹4个种的标本,其形态学雄性第一腹肢形态特征可分为3种类型:①末部扁凹扭转型,漳州华溪蟹雄性的第一腹肢形态特征最为独特,其末节前半部扁而宽大,呈掌心样内凹,并明显向外方扭转,以及末端分叶等特征非常显眼而区别于已知华溪蟹种类;②末节收缩末缘具缺刻型,平和华溪蟹与其地域种之间共同特征是雄性第一腹肢末节收缩,末端具缺刻样分叶,两地蟹的末节收缩和末端裂隙程度,以及末部指向存在差异;③末部趋窄小且弯向腹外型,将乐华溪蟹、将乐华溪蟹地域种群和福建华溪蟹雄性第一腹肢十分相近,或易混淆,它们的末节形状、末部指向和弯曲程度等仅有细微差异.CO1基因测序获得的11条序列与GenBank获取的3条序列共同组成有效分子数据集,经比对及选择保守区,最终获得582个碱基位点,其中保守位点462个,可变位点120个,简约信息位点64个,自裔位点56个,碱基组成为:T(37.4％)、C(18.6％)、A(28.3％)、G(15.6％)、A+T(65.7％),具有后生动物普遍的AT偏向性.系统发生树显示,在平和华溪蟹分支中,采集于龙岩市武平县的标本与采集于漳州市(平和县、南靖县)分为两支,且两支间的遗传距离为0.025～0.029.除平和华溪蟹外,漳州华溪蟹、福建华溪蟹和将乐华溪蟹共同组成一分支.产于福建西南部永安市的福建华溪蟹与产于福建北部政和县福建华溪蟹,显示出极小的遗传差异.采集于龙岩市龙门镇的将乐华溪蟹与采集于漳州市的将乐华溪蟹形成两分支,两支间的遗传距离介于0.019～0.024之间,远大于后一分支内部的遗传距离(0.003～0.008).结论 基于CO1片段的DNA条形码分析进一步证实了雄性第一腹肢等形态特征在华溪蟹属分类鉴定中的可靠性,平和华溪蟹及将乐华溪蟹不同地域种群间均存在形态上的差异,DNA条形码亦支持物种地域种群存在向种外分化趋势.