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甘草幼苗响应干旱胁迫的光合、抗氧化特性及转录组分析
甘草幼苗响应干旱胁迫的光合、抗氧化特性及转录组分析
作者:
关思静
王楠
徐蓉蓉
葛甜甜
高静
彭亮
张岗
陈莹
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
药用植物
胁迫
生理特性
超氧化物歧化酶
过氧化物酶
富集分析
调控网络
摘要:
为探究乌拉尔甘草(Glycyrrhiza uralensis)对干旱胁迫的生理及分子响应机制,本研究采用聚乙二醇6000 (polyethylene glycol 6000, PEG-6000)模拟干旱的方法,测定乌拉尔甘草幼苗光合指标和抗氧化酶活性,并进行转录组测序分析。结果表明:干旱胁迫至7 d时,甘草的净光合速率(net photosynthetic rate, Pn)、气孔导度(stomatal conductance, Gs)、蒸腾速率(transpiration rate, Tr)到达最低值。相对叶绿素含量(soil and plant analyzer develotrnent, SPAD)表现为先上升后下降。干旱引起甘草的氧化应激,处理1 d时提高了叶片中过氧化氢酶(catalase, CAT)活性,降低了根中CAT活性。处理7 d时提高了根中过氧化物酶(peroxide, POD)活性,降低了根中超氧化物歧化酶(superoxide dismutase, SOD)活性。转录组分析结果显示,甘草地上部分和地下部分分别有差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs) 7 500和5 298个;基因本体(gene ontology, GO)富集结果表明,地上和地下两部分的DEGs在三大类的分布基本一致,均被显著富集到细胞过程、代谢过程、细胞结构、催化活性、转导活性等功能;京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)代谢途径富集分析表明,地上部分和地下部分DEGs均显著富集在转录因子、蛋白激酶、苯丙烷类生物合成和细胞色素P450等代谢途径。转录调控网络分析预测表明,ERF (ethylene responsive factor)、bHLH (basic helix-loop-helix)、NAC (NAM/ATAF/CUC)、MYB (v-myb avian myeloblastosis viral oncogene homolog)和WRKY 类转录因子可能与甘草次级代谢产物相关基因存在转录调控关系。综上,本研究揭示了干旱胁迫对甘草生理特性的影响,分析了不同部位基因的表达,可为今后研究甘草抗旱机制提供有价值的信息。
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篇名
甘草幼苗响应干旱胁迫的光合、抗氧化特性及转录组分析
来源期刊
草业科学
学科
关键词
药用植物
胁迫
生理特性
超氧化物歧化酶
过氧化物酶
富集分析
调控网络
年,卷(期)
2021,(1)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
2176-2190
页数
15页
分类号
文章编号:2020-06471
字数
语种
中文
DOI
10.11829/j.issn.1001-0629.2020-0647
五维指标
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研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
草业科学
主办单位:
中国草原学会
兰州大学草地农业科技学院
出版周期:
月刊
ISSN:
1001-0629
CN:
62-1069/S
开本:
大16开
出版地:
兰州市嘉峪关西路768号
邮发代号:
54-51
创刊时间:
1984
语种:
chi
出版文献量(篇)
7019
总下载数(次)
17
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