基于细胞毒性T淋巴细胞相关基因肝细胞癌预后模型的构建及功能分析

• 作者: 叶必成 缪夏晔 刘树青
• 来源期刊: 山东医药
• 关键词: 肝细胞癌 癌症基因组图谱 国际癌症基因组联盟 细胞毒性T淋巴细胞 预后模型
• 年，卷（期）: 2021,（19）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 63-67
• 页数: 5页
• 分类号: R735.7
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-266X.2021.19.016

摘要

目的 构建基于细胞毒性T淋巴细胞(CTL)相关基因肝细胞癌(HCC)预后模型,并验证其对HCC患者预后预测的价值.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)和国际癌症基因组联盟(ICGC)下载HCC患者mRNA基因表达谱数据及对应的临床信息,并使用Lasso-Cox回归构建基于TCGA队列的预后模型,ICGC队列用于外部验证.基因本体(GO)富集分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析及单样本基因集富集分析(ssGSEA)免疫细胞浸润及免疫相关功能激活情况.结果 本研究共确定了55个CTL相关的差异表达基因,37个CTL相关的差异表达基因与总生存期相关(P均<0.05),最终构建了包含6个基因的预后模型;受试者工作特征曲线证明了该模型的预测能力;富集分析表明离子通道和免疫相关途径显著富集.结论 成功构建了基于CTL相关基因的肝细胞癌预后模型,并验证了该模型有助于预测HCC患者预后.