胰腺癌差异表达基因的筛选及其功能分析

• 作者: 田莉 胡月明
• 来源期刊: 山东医药
• 关键词: 胰腺癌 生物信息学 差异表达基因 蛋白互作网络
• 年，卷（期）: 2021,（19）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 67-70
• 页数: 4页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-266X.2021.19.017

摘要

目的 筛选胰腺癌差异表达基因,并分析其功能.方法 基于生物信息学技术从GEO数据库获取胰腺癌相关表达数据,利用GEO2R在线工具寻找差异表达基因(DEG),并对上述基因进行GO功能分析和KEGG通路富集分析,利用Cytoscape软件构建蛋白互作网络图,并将筛选出的核心基因进行生存分析.结果 经筛选得到GSE15471和GSE62165数据集,共纳入157例胰腺癌组织和52例正常胰腺组织,分析得到548个共表达的DEG,其中表达上调基因476个、表达下调基因72个(P均<0.05).GO功能分析和KEGG通路富集分析发现DEG的功能主要涉及胶原蛋白分解代谢过程、细胞黏附、细胞外基质分解、ECM受体相互作用、补体和凝血级联、PI3K-Akt通路、细胞因子-受体相互作用等;经Cytoscape软件构建蛋白互作网络图得到6个核心基因为FN1、MMP2、PTPRC、IT-GAM、COL1A2和COL3A1,其中FN1、MMP2与患者的预后不良相关(P均<0.05).结论 DEG涉及的分子机制和信号通路与胰腺癌的发生、发展相关,6个核心基因可能是治疗胰腺癌的潜在靶点和生物标志物.