基于生物信息学探讨膝骨关节炎与骨质疏松之间的作用机制

• 作者: 赵群荣 薛海鹏 陈云刚 徐展望
• 来源期刊: 世界中西医结合杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 骨质疏松 膝骨关节炎 生物信息学
• 年，卷（期）: 2021,（10）
• 所属期刊栏目: 药物研究
• 页码范围: 1853-1857,1864
• 页数: 6页
• 分类号: R684.3|R681
• 语种: 中文
• DOI: 10.13935/j.cnki.sjzx.211016

摘要

目的 通过生物信息学相关技术方法依托相关数据库探讨膝骨关节炎与骨质疏松之间的相互影响机制.方法 分别以"骨质疏松"及"膝骨关节炎"为关键词在疾病基因数据库(DisGeNET),人类基因数据库(GeneCards),人类孟德尔遗传综合数据库(OMIM),综合型药物数据库(DrugBank)以及治疗靶标数据库(TTD)5个数据库中筛选相关基因,去重后将两组预测靶基因进行映射得到关键靶点,通过STRING网站获得靶点PPI互相作用网络,根据degree值筛选出核心靶点并通过DAVID数据库进行GO富集分析以及KEGG通路分析.结果 通过相关疾病数据库搜索筛选出与骨质疏松症和膝骨关节炎相关靶点分别为875个和734个,映射出关键靶点230个,以degree≥94筛选出核心靶点26个并导入DAVID数据库获得131项GO富集结果(P<0.05)及67条KEGG信号通路(P<0.05).结论 IL-6、INS、ALB、GAPDH、VEGFA等核心靶点通过作用于HIF-1信号通路、TNF信号通路、PI3K-Akt信号通路、Toll样受体信号通路、FoxO信号通路等多条特异性通路共同影响膝骨关节炎及骨质疏松的发生发展过程,为临床治疗两种疾病提供了科学的理论基础.