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基于转录组分析重金属镉对长茎葡萄蕨藻的影响
基于转录组分析重金属镉对长茎葡萄蕨藻的影响
作者:
庞美霞
黄志立
刘小龙
唐勇军
李晓东
金刚
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
长茎葡萄蕨藻
镉胁迫
分子机制
转录组
摘要:
随着人类社会工业化进程的加快,重金属镉(Cd)污染对海洋生物的毒害作用突显.为了探索Cd胁迫下长茎葡萄蕨藻生理调控的分子响应机制,本文采用RNA-Seq技术对镉胁迫(Hcd2+)藻体组织转录组进行研究.结果 表明:与对照相比,Hcd>组共筛选出差异表达基因(DEGs) 702个,其中,257个基因上调表达,445个基因下调表达.对获得的DEGs进行功能注释及富集分析,发现长茎葡萄蕨藻的多种生物学功能受到Cd2+胁迫的影响,最终表现为抑制生长.GO富集分析发现,长茎葡萄蕨藻体内氧自由基的产生与清除出现失衡,并产生了DNA损伤等氧化伤害.KEGG富集分析发现,长茎葡萄蕨藻中多条与光合作用相关途径受到抑制,表明Cd2+胁迫导致长茎葡萄蕨藻的光合反应紊乱.
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文献信息
篇名
基于转录组分析重金属镉对长茎葡萄蕨藻的影响
来源期刊
应用生态学报
学科
关键词
长茎葡萄蕨藻
镉胁迫
分子机制
转录组
年,卷(期)
2021,(12)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
4447-4456
页数
10页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.13287/j.1001-9332.202112.035
五维指标
传播情况
被引次数趋势
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引文网络
引文网络
二级参考文献
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共引文献
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参考文献
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2021(0)
参考文献(0)
二级参考文献(0)
引证文献(0)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
长茎葡萄蕨藻
镉胁迫
分子机制
转录组
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
应用生态学报
主办单位:
中国生态学学会
中国科学院沈阳应用生态研究所
出版周期:
月刊
ISSN:
1001-9332
CN:
21-1253/Q
开本:
大16开
出版地:
辽宁省沈阳市文化路72号
邮发代号:
8-98
创刊时间:
1990
语种:
chi
出版文献量(篇)
9946
总下载数(次)
16
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