基于高通量测序的土壤细菌组成、丰度及多样性分析

• 作者: 范娜 彭之东 白文斌
• 来源期刊: 中国农学通报
• 关键词: 高通量测序 高粱 盐碱地 土壤细菌组成、丰度 多样性分析
• 年，卷（期）: 2021,（20）
• 所属期刊栏目: 资源·环境·生态·土壤·气象
• 页码范围: 66-70
• 页数: 5页
• 分类号: X53
• 语种: 中文

摘要

研究盐碱地土壤微生物群落结构变化,细菌数量变化可以作为高粱耐盐材料筛选的标准之一,本研究将为高粱耐盐材料的选育及高粱耐盐性研究提供理论依据.试验采用Illumina Miseq高通量测序方法对盐碱地高粱根际菌群结构进行分析,选用10份不同的高粱亲本材料,采集盐碱地高粱根际土壤样品,研究结果表明:耐盐材料OTU数量较多,土壤微生物的群体数量的增加及其生长速率的增大可有效地促进土壤酶的活性,从而提高材料的生长速率;样品342、473的Chao1、ACE和Shannon指数均最高,Simpson指数最小,该材料的物种多样性最高;相反,盐敏材料68、622的Chao1、ACE和Shannon指数均最低,Simpson指数最大,多样性最低.研究结果表明耐盐材料根际土壤细菌具有较高的物种多样性,该指标可以作为耐盐材料筛选的评价指标.