基于TCGA构建胃癌免疫基因预后风险评估模型

• 作者: 王永强 彭际奎 姜洪伟 王举
• 来源期刊: 国际医药卫生导报
• 关键词: 癌症基因组谱图 胃癌 差异表达基因 Cox比例风险回归模型 预后
• 年，卷（期）: 2021,（13）
• 所属期刊栏目: 科研课题专栏
• 页码范围: 1919-1924
• 页数: 6页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1007-1245.2021.13.005

摘要

目的:构建基于免疫基因的胃癌预后评估模型。方法:从癌症基因组图谱数据库下载胃癌测序、临床数据并整理。将胃癌样本分为训练集（221例）、验证集（147例），在训练集中依次采用单因素、多因素Cox分析，构建免疫基因预后评估模型，并在验证集中验证。采用单样本富集分析将测序数据转化成28种免疫细胞比例的数据，分析高、低风险组与免疫细胞浸润的相关性。筛选高、低风险组差异基因并进行富集分析。结果:由9个免疫基因（PROC、IGKV1D-43、CLCF1、TAFA4、NOX4、INHA、ITGAV、FABP3、IL27RA）构建的风险评估模型，是影响胃癌预后的独立危险因素。训练集、验证集Kaplan-Meier生存曲线显示，对比低风险组，高风险组5年总生存率显著降低［50.5%（55/111）比20.0%（22/110），43.2%（32/74）比24.7%（18/73），均 P＜0.05］；训练集受试者工作特征曲线（ROC）第1、3、5年曲线下面积（AUC）值分别为0.69、0.71、0.78，验证集ROC第1、3、5年AUC值分别为0.56、0.71、0.78。另外，高风险组浸润的活化CD4 + T细胞的比例显著降低（ P＜0.05）。高、低风险组差异基因主要富集于PI3K-AKT等通路。 结论:基于生物信息学方法构建的胃癌预后评估模型可成为胃癌预后判断的新指标。