基于16S rDNA扩增子测序分析灵芝连作覆土细菌群落的变化

• 作者: 袁源 李琳 黄海辰 刘国辉 谢福泉 傅俊生 吴小平
• 来源期刊: 中国农学通报
• 关键词: 灵芝 细菌群落 细菌多样性 扩增子测序 连作障碍
• 年，卷（期）: 2021,（24）
• 所属期刊栏目: 生物科学
• 页码范围: 116-123
• 页数: 8页
• 分类号: S154.38
• 语种: 中文

摘要

揭示不同连作年限灵芝覆土中细菌群落的变化情况,为灵芝连作障碍机制的研究提供理论依据.以邻近沙壤土(GL0)为对照,采用Illumina MiSeq平台对灵芝栽培1年(GL1)、连作1年(GL2)、2年(GL3)和3年(GL4)的覆土进行扩增子测序.多样性分析表明,连作会加大灵芝覆土中细菌群落的物种组成差异,且细菌群落的丰富度和多样性均呈现先增加后减少的趋势.在门水平上,变形菌门和放线菌门的相对丰度随着连作年限的增加而显著性增加;绿弯菌门的相对丰度逐年递减.在属水平上,鞘氨醇单胞菌属、Anaeromyxobacter、慢生根瘤菌属、脱氯菌属和Ktedonobacter等在灵芝覆土中的相对丰度逐年递减,溶杆菌属、Gp6和Gp16的相对丰度显著提高.灵芝连作障碍可能与覆土中鞘氨醇单胞菌属、Anaeromyxobacter、慢生根瘤菌属、脱氯菌属等有益细菌相对丰度逐年降低有关.