甘蔗叶片响应褐锈病菌(Puccinia melanocephala)侵染的转录组分析

• 作者: 高小宁 吴自林 黄咏虹 刘睿 齐永文
• 来源期刊: 中国农学通报
• 关键词: 甘蔗 褐锈菌 亲和互作 高通量测序 转录组 差异表达基因
• 年，卷（期）: 2021,（24）
• 所属期刊栏目: 生物科学
• 页码范围: 102-109
• 页数: 8页
• 分类号: S432.4
• 语种: 中文

摘要

旨在从转录水平分析甘蔗叶片响应褐锈病菌侵染的基因表达特征,为进一步研究甘蔗抗褐锈病的分子机理提供基础资料.本研究采用高通量测序技术Illumina Hiseq 2500对健康以及被褐锈病菌侵染的甘蔗叶片进行转录组测序,利用生物信息学方法对差异表达基因进行功能注释和分析,利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)对5个差异基因的相对表达量进行了验证.转录组数据分析共鉴定出差异表达基因4716个,其中上调表达2979个,下调表达1737个.GO注释结果显示,差异表达基因主要聚集在细胞过程、生物过程、催化活性等生理生化过程.KEGG富集分析发现,1919个差异表达基因被注释到114个通路中,其中苯丙烷生物合成、类黄酮生物合成、谷胱甘肽代谢等植物抵御生物胁迫有关的代谢途径的相关基因显著上调表达.qRT-PCR验证5个上调表达基因结果与转录组测序结果的表达趋势一致.