番茄ERFb.2转录因子的克隆、生物信息学及表达特征分析

• 作者: 金宝霞 魏小红 朱晓林 王伟杰
• 来源期刊: 北方园艺
• 学科: 农学
• 关键词: 番茄 EFRb.2 生物信息学 表达分析
• 年，卷（期）: 2021,（23）
• 所属期刊栏目: 研究论文|Research Papers
• 页码范围: 1-10
• 页数: 10页
• 分类号: S641.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.11937/bfyy.20212435

摘要

通过克隆番茄SlERFb.2基因,并运用生物信息学对该基因的编码产物进行一级、二级、三级结构分析,并通过qRT-PCR技术检测SlERFb.2基因在不同处理不同时期的表达量,以期为番茄对非生物胁迫的响应机制提供参考依据.结果 表明:SlERFb.2基因含有开放阅读框5个,共编码258个氨基酸,属于酸性蛋白;其二级结构以α-螺旋为主,预测蛋白定位于细胞核上;且含有39个磷酸化位点与15个糖基化位点;启动子区主要以I-box为主,且含有多个诱导基因表达的顺势作用元件;三级结构相对简单,且该转录因子在番茄中存在4个互作蛋白,系统发育树得番茄与马铃薯的亲缘关系最近;qRT-PCR显示该基因对低温的响应特别敏感.