苦荞粒重基因FtGW8的生物信息学分析

• 作者: 石桃雄 汪燕 黄娟 梁成刚
• 来源期刊: 安徽农学通报
• 关键词: 苦荞 粒重基因 同源比对分析 蛋白质结构
• 年，卷（期）: 2021,（15）
• 所属期刊栏目: 基因分子·生理生化·遗传育种·组织培养
• 页码范围: 29-32,50
• 页数: 5页
• 分类号: Q74
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-7731.2021.15.012

摘要

种子大小和重量是荞麦产量构成的关键因素.该研究基于水稻粒重基因GW8,对苦荞粒重基因进行了生物信息学分析,结果表明,苦荞粒重FtGW8基因CDS序列长768bp,编码的蛋白质包含255个氨基酸,分子量为27.97kD,等电点为9.5,属于亲水性蛋白,具有跨膜结构,与水稻GW8蛋白相似.预测FtGW8蛋白定位于细胞核内,其二级结构主要由α螺旋和无规则卷曲组成,预测的三级结构与二级结构基本一致.蛋白功能分析发现,FtGW8和水稻GW8蛋白均具有SBP功能域,表明其可能具有控制粒重的功能.该研究为苦荞粒重基因的克隆奠定了基础.