MiR-506-3p在肾透明细胞癌中作用的生物信息学分析

• 作者: 周凯 苏琪盛 黎承杨
• 来源期刊: 世界最新医学信息文摘（连续型电子期刊）
• 关键词: miR-506-3p microRNA 靶基因 肾透明细胞癌 生物信息
• 年，卷（期）: 2021,（27）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 49-51
• 页数: 3页
• 分类号: R256.5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-3141.2021.27.016

摘要

目的 使用生物信息学的手段对miR-506-3p在肾透明细胞癌中作用进行分析,探究其生物学功能及调控机制.方法 使用starbase平台分析miR-506-3p在肾透明细胞癌中的表达,通过GEO2R对GSE40435、GSE53757、GSE68417三个数据集进行差异基因表达分析,选择miRDIP数据库预测miR-506-3p靶基因,通过mirtarbase及文献查找实验证实的靶基因作为进一步生物信息学分析的基因集合,对靶基因与上调基因取交集.使用networkanalyst构建蛋白互作网络.结果 预测得到SP1、CREB1、VIM、NR3C1、ETS1、BCL6、IQGAP1在透明细胞癌中高表达且编码蛋白在靶基因蛋白互作网络中处于中心地位.结论 miR-506-3p可能通过靶向SP1、CREB1、VIM、NR3C1、ETS1、BCL6、IQGAP1等基因从而在肾透明细胞癌中发展发挥作用.