F3代波杂山羊XKR4基因多态性与生长性状的关联分析

• 作者: 阮涌 陈祥 田贵刚 安冬伟 邹启顺
• 来源期刊: 南方农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: F3代波杂山羊 XKR4基因 SNP位点 生长性状 关联性
• 年，卷（期）: 2022,（6）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医·水产·蚕桑
• 页码范围: 1752-1758
• 页数: 6页
• 分类号: S827.92
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2022.06.029

摘要

【目的】明确F3代波杂山羊XKR4基因多态性与生长性状的关联性，筛选出优异基因为后期培育新品系提供理论依据。【方法】以F3代波杂山羊为研究对象，通过血液DNA混池测序鉴定XKR4基因SNP位点，统计SNP位点的等位基因频率、基因型频率、遗传纯合度（Ho）、期望杂合度（He）、有效等位基因数（Ne）及多态信息含量（PIC）等，以卡方（c2）检验分析基因型是否处于Hardy-Weinberg平衡状态，并利用SPSS 25.0分析不同基因型与F3代波杂山羊生长性状的关联性。【结果】F3代波杂山羊XKR4基因Intron-1区域存在2个SNPs位点，分别是C194069A和T194091A。C194069A位点的等位基因频率中C>A，优势基因型为CC型；T194091A位点的等位基因频率中T>A，优势基因型为TT型；C194069A和T194091A位点均处于Hardy-Weinberg平衡（P>0.05）。关联分析结果表明：在初生群体中，T194091A位点AA基因型与其他基因型的体斜长存在显著差异（P<0.05，下同）；在3月龄群体中，C194069A和T194091A位点各基因型的生长性状指标间均无显著差异（P>0.05，下同）；在6月龄群体中，C194069A和T194091A位点AA基因型的体重分别与相应位点的CC基因型和TT基因型存在显著差异；在12月龄群体中，C194069A位点AA基因型在体重和胸围方面均极显著优于CC基因型（P<0.01，下同），在体高方面与CC基因型存在显著差异，T194091A位点AA基因型的体重、体斜长分别与TT基因型呈显著或极显著差异。此外，在0~6月龄和0~12月龄，C194069A和T194091A位点AA基因型的日增重与CC基因型和TT基因型分别存在呈显著或极显著差异。【结论】F3代波杂山羊XKR4基因存在2个SNPs位点（C194069A和T194091A），且均表现为AA基因型个体的生长性能优于其他基因型个体，即XKR4基因可作为F3代波杂山羊生长性状的候选基因。