鸭茅响应水淹胁迫的 miRNA 差异表达分析

• 作者: 杨兴云 乔丹丹 张雅洁 王少青 任俊才 李明阳 屈明好 尚盼盼 杨成 黄琳凯 曾兵
• 来源期刊: 草业学报
• 关键词: 鸭茅 水淹胁迫 耐涝 miRNA 差异表达
• 年，卷（期）: 2022,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 150-162
• 页数: 12页
• 语种: 中文
• DOI: 10. 11686/cyxb2021130

摘要

水淹胁迫是限制我国西南地区鸭茅产量和品质提升的主要环境因子，已经成为一种不容忽视的非生物胁迫。鉴定鸭茅耐涝相关的功能基因，并探究其调控机制是鸭茅种质创新，提高鸭茅耐涝能力的必要途径。以鸭茅耐涝品种“滇北”为试验材料，分别经水淹胁迫处理0、8和24 h后，利用Illumina Hiseq测序平台对鸭茅叶片进行小RNA测序。结果表明，在水淹胁迫处理下共鉴定得到208个差异表达基因（DEGs），经过筛选后有38个基因上调表达，34个基因下调表达，共占差异表达基因的34.62%。“滇北”鸭茅在水淹胁迫下差异表达基因主要属于miR166、miR167、miR159、miR396和miR156这5个miRNA基因家族。基于对差异miRNA进行靶基因预测及靶基因的GO和KEGG功能分析，发现这些靶基因主要参与细胞生理过程、代谢过程、IL-17信号通路、Th17细胞分化等植物逆境响应过程，为进一步揭示鸭茅在水淹胁迫下的分子调控机制提供了研究线索。