基于nSSR和cpDNA序列的城步峒茶群体遗传多样性和结构研究

• 作者: 刘振 成杨 杨培迪 赵洋 宁静 杨阳
• 学科: 农学
• 关键词: 茶树 城步峒茶 nSSR cpDNA 遗传多样性 群体结构
• 年，卷（期）: 2022,（2）
• 页码范围: 250-258
• 页数: 8页
• 分类号: S571.1,S324
• 语种: 中文

摘要

采用简单重复序列标记（nSSR）与叶绿体DNA序列（cpDNA）分析技术，对城步峒茶群体进行了遗传多样性、遗传结构和遗传分化等研究。结果表明，15对nSSR引物在参试81份资源中共获得142个等位位点，平均每对引物9.47个，城步峒茶群体的观测杂合度（Ho）、期望杂合度（He）和Nei期望杂合度（Nei）分别为0.49、0.62和0.62，具有较高的遗传多样性。Structure分析将79份峒茶资源分成3个类群，但各类群的遗传背景较为复杂，没有明显的群体结构。F检验表明，城步峒茶群体的近交系数FIS为正值（FIS=0.1775），群体间的遗传分化系数FST较小（FST=0.0345），分化程度较低，基因流Nm较高（Nm=7.01）。3对cpDNA引物分别获得了473bp（rbcL）、704bp（matK）和320bp（psbH-trnA）的片段序列，变异位点占总位点的比例分别为0.42%、0.71%和1.25%。将3个序列依次拼接，共产生了9个单倍型，单倍型数由多到少的居群依次为TXZ(6)、DZC(4)、DPS(4)、TYS(3)、HJZ(2)，群体的单倍型多样性（Hd）和核苷酸多样性（π）分别为0.732和0.00139。9个单倍型中，单倍型H1和H5处于进化网络图的中心节点上，并且包含资源数量最多，属于比较原始的单倍型。同时，nSSR和cpDNA的AMOVA分析结果基本一致，居群内的变异百分比分别达到96.69%和80.54%，城步峒茶的遗传变异主要存在于居群内。