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茶树果胶乙酰酯酶家族成员的鉴定和生物信息学分析
茶树果胶乙酰酯酶家族成员的鉴定和生物信息学分析
作者:
刘艳丽
马林龙
曹丹
金孝芳
冯琳
龚自明
原文服务方:
茶叶科学
茶树
果胶乙酰酯酶
鉴定
生物信息学分析
摘要:
茶树是氟的超富集植物,叶片高氟含量与人体健康密切相关。果胶乙酰酯酶(PAE)可能通过调控果胶的去乙酰化作用参与茶树叶片对氟的富集和解毒,然而目前并无茶树 PAEs 的相关报道。本研究以茶树舒茶早基因组和三代测序数据为基础,利用生物信息学的方法开展了 PAEs 的鉴定及其特性、进化和定位分析。结果表明,在茶树中,PAE 家族有 12 个蛋白,属于 PAE5、PAE8、PAE9、PAE10、PAE12 等 5 个成员,具有CLDG、PxYH、GGGWC、GS、NWN、rYCDG、GCSAG、NaAYDSWQ、HCQ 等 9 个保守基序;在进化关系上,茶树 PAEs 与葡萄、可可亲缘关系较近;12 个 CsPAEs 氨基酸大小为 326~515,分子量为 36.7~56.9 kDa,等电点为 5.1~8.9;除 CsPAE5、CsPAE5-1 定位线粒体,CsPAE10-1 可能定位胞质外,其他 9 个 CsPAEs 定位细胞壁;CsPAE5、CsPAE5-1、CsPAE12 和 CsPAE12-1 为跨膜蛋白。此研究结果将为解析 PAE 在茶树叶片氟富集和解毒过程中的功能奠定基础。
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文献信息
篇名
茶树果胶乙酰酯酶家族成员的鉴定和生物信息学分析
来源期刊
学科
农学
关键词
茶树
果胶乙酰酯酶
鉴定
生物信息学分析
年,卷(期)
2022,(5)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
521-529
页数
8页
分类号
S571.1,S154.1
字数
语种
中文
DOI
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传播情况
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茶树
果胶乙酰酯酶
鉴定
生物信息学分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
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相关学者/机构
期刊影响力
茶叶科学
主办单位:
中国茶叶学会、中国农业科学院茶叶研究所
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-369X
CN:
33-1115/S
开本:
大16开
出版地:
浙江省杭州市梅灵南路9号
邮发代号:
创刊时间:
1964-08-01
语种:
中文
出版文献量(篇)
504
总下载数(次)
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