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SNP rs951781影响食管癌患者的术后生存
SNP rs951781影响食管癌患者的术后生存
作者:
孙琳
宋昕
魏梦霞
赵学科
徐瑞华
李贝
范宗民
韩雪娜
陈亚杰
钟侃
乔佳欣
马琳琳
谢叶真
王立东
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
单核苷酸多态性
食管癌
β-肌动蛋白
全外显子测序
生存分析
摘要:
目的 探讨巢蛋白(NES)基因单核苷酸多态性(SNP)位点rs951781对食管癌进展和预后的影响.方法 对来自高发地区医院的199例食管癌患者的癌组织和癌旁配对组织,采用全外显子测序(WES)方法检测NES-rs951781基因SNP,比较不同SNP型(野生型纯合子CC型、突变型杂合子CT和突变型纯合子TT)分布频率,并用K-M曲线比较不同SNP型患者的生存期,用表达数量性状基因座(eQTL)技术对其进行功能注释.结果 NES-rs951781存在SNP,野生型纯合子CC型占79.40%,突变型杂合子CT型占18.60%,突变型纯合子TT型占2.01%;野生型纯合子CC型的0.5、1、1.5 a生存率(87.97%、71.52%、58.23%)均低于突变型纯合子TT型.NES-rs951781对β-肌动蛋白(ACTB)的转录表达水平有trans-eQTL作用,使ACTB蛋白表达下调(beta=-0.43).结论 NES-rs951781位点TT基因型患者生存最好;NES-rs951781可能通过下调ACTB蛋白表达影响食管癌的发生发展.
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文献信息
篇名
SNP rs951781影响食管癌患者的术后生存
来源期刊
食管疾病
学科
医学
关键词
单核苷酸多态性
食管癌
β-肌动蛋白
全外显子测序
生存分析
年,卷(期)
2022,(1)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
1-4
页数
4页
分类号
R735.1
字数
语种
中文
DOI
10.15926/j.cnki.issn2096-7381.2022.01.001
五维指标
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献
(0)
共引文献
(0)
参考文献
(0)
节点文献
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同被引文献
(0)
二级引证文献
(0)
2022(0)
参考文献(0)
二级参考文献(0)
引证文献(0)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
单核苷酸多态性
食管癌
β-肌动蛋白
全外显子测序
生存分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
食管疾病
主办单位:
河南科技大学
出版周期:
季刊
ISSN:
2096-7381
CN:
41-1455/R
开本:
大16开
出版地:
洛阳市开元大道263号
邮发代号:
36-287
创刊时间:
1982
语种:
chi
出版文献量(篇)
110
总下载数(次)
2181
总被引数(次)
21
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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