程式指数法和InDel分子指数法对云南元江稻属资源籼粳分化的比较研究

• 作者: 陈越 付坚 张敦宇 李婷婷 陈玲
• 来源期刊: 云南农业大学学报（自然科学）
• 学科: 农学
• 关键词: 云南元江普通野生稻 渗入系 籼粳属性 程式指数法 InDel分子指数法
• 年，卷（期）: 2022,（2）
• 页码范围: 185-192
• 页数: 8页
• 分类号: S511.024
• 语种: 中文

摘要

[目的]研究云南元江普通野生稻及其后代的籼粳属性及籼粳分化程度,为探索普通野生稻的起源演化、遗传分化及育种利用等提供理论依据.[方法]利用程式指数法和InDel分子指数法从表型到分子水平对云南元江普通野生稻(Oryza rufipogon)、栽培稻合系35号及354份渗入系后代进行粳籼属性分析.[结果]程式指数法分析结果表明:普通野生稻总分11分,为偏籼型;合系35号总分24分,为粳型;354份渗入系中有籼型材料179份、偏籼型76份、粳型25份和偏粳型74份;经InDel分子指数法鉴定发现:普通野生稻和合系35号的籼型基因频率分别为0.32和0.04,分别属于偏粳型和典型粳稻;在354份渗入系中有典型籼稻113份、籼稻84份、偏籼36份、中间类型29份、偏粳21份、粳稻24份和典型粳稻47份.综合程式指数法和InDel分子指数法分析结果表明:2种方法的拟合度高达92.42％,仅普通野生稻及26份渗入系的籼粳类型划分结果存在偏差.[结论]程式指数法和InDel分子指数法鉴定稻属资源籼粳属性的结果基本一致,2种方法结合应用可有效分析普通野生稻及其渗入系后代的籼粳属性;普通野生稻籼粳属性在表型和分子水平上存在一定差异,可能与普通野生稻籼粳分化不彻底有关.云南元江普通野生稻渗入系后代的籼粳类型丰富、分化明显,是重要的育种材料,也是研究普通野生稻起源、进化及分类的宝贵资源.