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茶树紫芽中花青素形成相关基因差异表达分析
茶树紫芽中花青素形成相关基因差异表达分析
作者:
向奕
刘硕谦
龚志华
陈栋
肖文军
原文服务方:
茶叶科学
茶树
花青素
差异基因
转录组测序
生物信息学分析
摘要:
花青素是一类广泛存在于植物中的水溶性色素,作为一种强自由基清除剂,它具有抗炎,抗氧化,降血压,降血糖等多种保健功能。紫芽茶树作为一种高花青素含量的特异性茶树资源,其研究与利用越来越受人们的关注。为了解茶树紫芽中花青素形成的分子机理,本研究通过对湖南农业大学自选紫芽品种9803与绿芽品种9806进行转录组测序及生物信息学分析,筛选得到42条与花青素代谢相关的unigene,其中比对到参考基因组中的有34条,未在参考基因组中登录的有8条。KEGG富集分析表明这42个基因被富集到5个代谢通路中,包括类黄酮合成途径,木质素合成途径,黄酮和黄酮醇合成途径,油菜素甾醇合成途径,以及参与转录因子的编码。通过荧光定量PCR验证,差异基因荧光定量PCR变化趋势与转录组测序结果一致,转录组测序数据可靠。本次试验在转录组水平上筛选出了茶叶紫芽花青素代谢相关的差异基因,为进一步揭示茶叶紫芽产生的分子机理奠定了基础。
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茶树品种
花青素
数字表达普
差异表达基因
不同叶色茶树品种(系)花青素合成相关基因的表达水平
茶树
花青素
结构基因
表达分析
内容分析
文献信息
版权信息
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相关学者/机构
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期刊文献
内容分析
关键词云
关键词热度
相关文献总数
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文献信息
篇名
茶树紫芽中花青素形成相关基因差异表达分析
来源期刊
学科
农学
关键词
茶树
花青素
差异基因
转录组测序
生物信息学分析
年,卷(期)
2022,(5)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
439-449
页数
10页
分类号
S571.1,Q52
字数
语种
中文
DOI
五维指标
传播情况
被引次数趋势
(/次)
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版权信息
全文
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2022(0)
参考文献(0)
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引证文献(0)
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研究主题发展历程
节点文献
茶树
花青素
差异基因
转录组测序
生物信息学分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
茶叶科学
主办单位:
中国茶叶学会、中国农业科学院茶叶研究所
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-369X
CN:
33-1115/S
开本:
大16开
出版地:
浙江省杭州市梅灵南路9号
邮发代号:
创刊时间:
1964-08-01
语种:
中文
出版文献量(篇)
504
总下载数(次)
0
总被引数(次)
0
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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