茶树PPO基因家族的鉴定与分析

• 作者: 曾泽媛 罗勇 郑楚楚 李娟 李勤 林海燕 王坤波
• 学科: 农学
• 关键词: 茶树 多酚氧化酶 基因家族 序列分析
• 年，卷（期）: 2022,（4）
• 页码范围: 385-395
• 页数: 10页
• 分类号: TS272.2,Q52
• 语种: 中文

摘要

多酚氧化酶（Polyphenol oxidases,PPO）是由核酸编码的一种以氧为受体的含铜金属酶，为一种末端氧化酶，在茶叶加工中也发挥重要的作用。从最新发布的茶树基因组数据库中获得了5条PPO基因：CsPPO1、CsPPO2、CsPPO3、CsPPO4（GenBank登录号为GQ129142.1）、CsPPO5。本研究利用生物信息学方法，对5条基因的核酸序列和氨基酸序列进行分析，并对基因编码蛋白的理化性质和结构功能进行预测。结果表明，5个基因CDS区全长在597~1839bp之间，编码氨基酸数目198~612；系统进化树分析显示CsPPO1、CsPPO3、CsPPO4和CsPPO5具有较近的亲缘关系；编码的蛋白均属于亲水性不稳定类脂类结合蛋白，都不具有信号肽；无规则卷曲是蛋白质的主要结构元件，α-螺旋和β-折叠分散于整个多肽链中，CsPPO1、CsPPO2、CsPPO3可能存在一个或多个跨膜螺旋；5个蛋白均含有PPO1_DWL（pfam12142）保守结构域，除了CsPPO2外，其余4个蛋白均预测到TYROSINASE功能结构域。实时定量PCR结果表明，PPOs基因在不同茶树品种间呈现出不同的表达模式。