广东省2株白喉棒状杆菌的鉴定与分析

• 作者: 李振翠 刘美真 方艳梅 贡梓军 王旭麟 陈经雕 李柏生
• 来源期刊: 中华预防医学杂志
• 关键词: 白喉棒状杆菌 全基因组测序 wgSNP进化树 鉴定
• 年，卷（期）: 2022,（4）
• 所属期刊栏目: 传染病实验室监测与溯源
• 页码范围: 427-432
• 页数: 6页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.cn112150-20210517-00478

摘要

目的:对广东省2株 C. diphtheriae白喉棒状杆菌进行精准鉴定与分析。 方法:通过API Coryne棒状杆菌生化卡对2010年广州和2020年珠海分离的 C. diphtheriae进行生化及质谱鉴定；利用Illumina平台进行测序，CLC软件拼接，JSpeciesWS线上工具进行平均核苷酸同源性识别；BLASTN进行 narKGHIJ和 tox基因检测，使用MEGA-X构建wgSNP系统发育进化树。 结果:GD-Guangzhou-2010为Belfanti型，GD-Zhuhai-2020为Gravis型。棒状杆菌种间ANI值计算结果显示，GD-Guangzhou-2010与 C.belfantii间ANIb=99.61%，GD-Zhuhai-2020与 C. diphtheriae间ANIb=97.64%。BLASTN结果显示，GD-Guangzhou-2010硝酸盐还原基因 narKGHIJ均为阴性且未携带 tox基因，GD-Zhuhai-2020硝酸盐还原基因 narKGHIJ均为阳性，未携带 tox基因。 C. diphtheriae的wgSNP进化树显示两个主要进化分支，第一个分支包含所有Mitis型和Gravis型以及GD-Zhuhai-2020，第二个分支包含所有的 C.belfantii、 C.diphtheriae subsp. lausannense分离株及GD-Guangzhou-2010。 结论:广东省成功分离鉴定出两株非产毒性 C. diphtheriae，系统发生树提示GD-Guangzhou-2010和GD-Zhuhai-2020位于两个不同的进化分支。