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牦牛FTO基因克隆及表达分析
牦牛FTO基因克隆及表达分析
作者:
顾亚荣
马兰花
王福彬
张永峰
阎萍
潘和平
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
牦牛
脂肪量和肥胖相关基因(FTO)克隆
生物信息学分析
组织表达
脂肪细胞表达
摘要:
脂肪量和肥胖相关基因(fat mass and obesity associated gene,FTO)属于非血红素加双氧酶超家族成员,在哺乳动物脂肪发育中具有重要作用.本研究以青海大通牦牛(Bos grunniens)为研究对象,利用RT-PCR扩增获得FTO基因CDS区,运用生物信息学在线软件对其功能和结构进行预测;同时采用qPCR技术对FTO基因在牦牛不同时期(18和30月龄)、不同组织(心,肝,脾,肺,肾,背最长肌,皮下脂肪)以及牦牛前体脂肪细胞诱导分化不同时期(0,4,8和12 d)的表达规律进行分析.结果显示,牦牛FTO基因CDS(GenBank No.OM640141)全长为1518 bp,编码505个氨基酸.FTO蛋白主要由α-螺旋(44.36%)、无规则卷曲(38.42%)、延伸链(10.89%)以及β-转角(6.34%)组成,无跨膜结构和信号肽,属于不稳定的亲水性蛋白.系统进化树结果显示,大通牦牛FTO氨基酸序列与普通牛的同源性为99.80%,遗传距离最近;与瘤牛(Bos indicus)和野牦牛(Bos mutus)的亲缘性较近,与马(Equus przewalskii)亲缘性最远.qPCR结果显示,FTO在牦牛心脏和皮下脂肪组织中的基因表达量最高,在脾脏中最低;FTO在30月龄皮下脂肪中的基因表达量极显著高于18月龄(P<0.05);在牦牛肾周脂肪细胞诱导分化的不同时期,FTO基因表达量在4、8和12 d均显著下降(P<0.05);Western blot检测结果显示,FTO蛋白表达的变化趋势与基因表达结果一致.本研究可为深入探讨FTO基因在牦牛脂肪发育中的生物学功能提供基础资料.
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文献信息
篇名
牦牛FTO基因克隆及表达分析
来源期刊
农业生物技术学报
学科
农学
关键词
牦牛
脂肪量和肥胖相关基因(FTO)克隆
生物信息学分析
组织表达
脂肪细胞表达
年,卷(期)
2022,(4)
所属期刊栏目
研究论文与报告|Articles and Letters
研究方向
页码范围
667-675
页数
9页
分类号
S823.8+5
字数
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1674-7968.2022.04.005
五维指标
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献
(0)
共引文献
(0)
参考文献
(0)
节点文献
引证文献
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同被引文献
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二级引证文献
(0)
2022(0)
参考文献(0)
二级参考文献(0)
引证文献(0)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
牦牛
脂肪量和肥胖相关基因(FTO)克隆
生物信息学分析
组织表达
脂肪细胞表达
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
农业生物技术学报
主办单位:
中国农业大学
中国农业生物技术学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1674-7968
CN:
11-3342/S
开本:
大16开
出版地:
北京海淀区圆明园西路2号中国农业大学生命科学楼1053室
邮发代号:
2-367
创刊时间:
1993
语种:
chi
出版文献量(篇)
4211
总下载数(次)
8
总被引数(次)
40364
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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