基于转录组测序技术对调控毕加索小丑鱼(Picasso clownfish)白化体征关键基因的研究

• 作者: 何丽斌 黄镇 吴水清 郑乐云
• 来源期刊: 海洋学报（中文版）
• 学科: 农学
• 关键词: 白化现象 毕加索小丑鱼 转录组测序 差异表达基因
• 年，卷（期）: 2022,（2）
• 所属期刊栏目: 海洋生物|Marine Biology
• 页码范围: 67-76
• 页数: 10页
• 分类号: S965.8
• 语种: 中文

摘要

毕加索小丑鱼(Picasso clownfish)因其皮肤中的白色斑块分布杂乱抽象而得名,同时也由于其白色斑块的形成无规律性和稀缺性,属于名贵的小丑鱼,因此,解析毕加索小丑鱼的皮肤白斑形成机制,可以为毕加索小丑鱼的人工育种提供理论依据.在本研究中,我们对3种体色毕加索小丑鱼的背鳍和臀鳍之间的身体相同部位3种色块(黑色、黄色、白色)的皮肤进行进行了转录组测序.研究结果显示,与黄色和黑色皮肤组织相比,在白色皮肤组织中存在大量差异表达基因.其中与黑色素产生相关的信号通路(例如黑色素生成、Hedgehog信号通路和Wnt信号通路)中的基因在白色皮肤组织中呈下调表达趋势.进一步对3种颜色皮肤组织中参与黑色素生成途径的基因进行详细分析,发现上游调控基因(如ednrba和mitfa)表达量从黑色到黄色至白色皮肤组织中逐步下调,但下游参与黑色素合成的核心基因(包括tyr、tyrp1b和dct)则在白色皮肤组织中表达出现显著下调.最后,本研究通过荧光定量PCR验证了转录组数据的可靠性.本研究结果将为今后人为干扰基因表达从而达到调控小丑鱼体色提供理论依据.