基于16S rRNA基因对濒危脊椎动物鉴定的可行性

• 作者: 蒋晓霞 徐博文 李伟刚 邵建宏 周傲白雪 唐泰山 赵福振 苗丽 黄海超 罗宝正
• 来源期刊: 野生动物学报
• 关键词: 濒危脊椎动物 16S rRNA 种属鉴定
• 年，卷（期）: 2023,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文|ORIGINAL PAPERS
• 页码范围: 51-57
• 页数: 6页
• 分类号: Q953
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-0127.2022.01.008

摘要

为探索16 S rRNA基因条形码技术在濒危脊椎动物物种鉴定中的可行性,选取脊椎动物线粒体16 S rRNA基因中长度为286 bp的片段设计通用引物,以哺乳纲(Mamma-lia)、爬行纲(Reptilia)、两栖纲(Amphibia)、软骨鱼纲(Chondrichthyes)和辐鳍鱼纲(Ac-tinopterygii)中24科、28属、40种共71个濒危脊椎动物样本为研究对象,进行PCR扩增并对扩增产物进行纯化、测序和基因序列分析.结果显示:建立的检测方法灵敏度可以达0.001 ng/μL,其中62个(39个物种)样本扩增成功,57个样本(34个物种)测序结果与GenBank数据库中的参考序列具有较高相似度,可以鉴定到种的水平.测序所得的基因序列与参考序列的种内遗传距离为0～0.5％、种间遗传距离为1.0％～39.9％,最小种间遗传距离大于最大种内遗传距离,即存在明显的条形码间隔;另外5个样本(5个物种)测序结果在属内种间高度一致,只能鉴定到属的水平.基于16S rRNA基因片段构建的条形码可对濒危脊椎动物进行种属鉴定,可为濒危物种保护、打击非法走私等提供技术支撑.