分子对接技术筛选沉香中抗新型冠状病毒活性成分

• 作者: 王倩 刘俊成 宋瑗瑗 胡峰 蒋革
• 来源期刊: 华南师范大学学报（自然科学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 分子对接 沉香 新型冠状病毒 新型冠状病毒肺炎 虚拟筛选
• 年，卷（期）: 2022,（1）
• 所属期刊栏目: 生物学与生物工程|Biology & Bioengineering
• 页码范围: 54-60
• 页数: 7页
• 分类号: R285
• 语种: 中文
• DOI: 10.6054/j.jscnun.2022009

摘要

从沉香中筛选潜在的抗新型冠状病毒活性成分,指导以沉香小分子作为SARS-CoV-2潜在阻断剂和抑制剂药物的研发.根据沉香已知的化学成分,采用分子对接的方法,以血管紧张素转化酶-2(ACE2)、SARS-CoV-2的3CL水解酶(3CLpro)为靶标,通过结合打分值以及与靶蛋白受体的相互作用模式,获得沉香中具有潜在抗SARS-CoV-2活性的化学成分.分子对接结果表明:共有6种化学成分可作为ACE2结合阻断剂,有4种化学成分可作为3CLpro抑制剂,且均为2-(2-苯乙基)色酮类化合物;主要作用方式为氢键、疏水、π-π共轭作用力,其中5,6,7,8-四羟基-2-(3-羟基-4-甲氧基苯乙基)-5,6,7,8-四氢-4H-色原烯与靶标蛋白形成的氢键数目最多,分子对接效果最优.基于分子对接的虚拟筛选方法可快速筛选沉香中潜在的抗新型冠状病毒活性成分,其中5,6,7,8-四羟基-2-(3-羟基-4-甲氧基苯乙基)-5,6,7,8-四氢-4H-色原烯可优选作为后续抗SARS-CoV-2药物的研究.研究结果可指导以沉香小分子为前体的COVID-19的新药研发.