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摘要:
目的 研究6-磷酸果糖-2-激酶/果糖-2,6-二磷酸酶4(PFKFB4)的表达水平与宫颈癌患者临床病理特征和预后的关系,并探讨PFKFB4在宫颈癌进展中的调控网络.方法 利用Linked Omics数据平台分析PFKFB4的表达与宫颈癌患者临床病理特征及预后的关系.利用Linked Omics的Link Finder模块Gene Set Enrichment Analysis(GSEA)对差异相关基因进行基因本体(GO)[细胞成分(CC),生物过程(BP)和分子功能(MF)]分析.KEGG信号通路分析激酶靶标富集,miRNA靶标富集和转录因子靶标富集.cBioPortal用于分析PFKFB4在宫颈癌中的变异频率和类型.Gene MANIA用于分析与PFKFB4存在相互作用的基因以及主要涉及的功能.结果 PFKFB4与宫颈癌的T分期、N分期和M分期显著相关;T分期越高、有淋巴结转移(N1)、伴有远处转移(M1)者PFKFB4表达量越高;PFKFB4高表达患者的总生存显著差于低表达患者(P=0.002);GO分析提示PFKFB4相关基因与蛋白结合、离子结合、核酸结合、水解酶活动、转移酶活动等相关;KEGG信号通路富集分析则发现,PFKFB4及相关基因在宫颈癌中主要参与了缺氧诱导因子HIF1信号通路、糖酵解/糖再生信号通路、果糖和甘露糖代谢通路等;GSEA分析显示,MK2PK1、CHEK1、miR-200a、miR-18a、HIF1、AP1与PFKFB4的表达显著相关;cBioPortal分析显示,PFKFB4在宫颈癌中主要变异形式为mRNA高表达,但是突变频率较低.结论 PFKFB4是宫颈癌一个潜在的预后标记物.通过数据挖掘揭示了PFKFB4的潜在调控网络信息,为进一步研究PFKFB4在宫颈癌中的作用奠定基础.
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文献信息
篇名 基于数据挖掘的PFKFB4在宫颈癌中的表达和基因调控网络研究
来源期刊 海南医学 学科 医学
关键词 6-磷酸果糖-2-激酶/果糖-2 6-二磷酸酶4 宫颈癌 生物信息学 诊断 预后
年,卷(期) 2022,(2) 所属期刊栏目 临床研究|Clinical Research
研究方向 页码范围 137-142
页数 6页 分类号 R737.33
字数 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1003-6350.2022.02.001
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研究主题发展历程
节点文献
6-磷酸果糖-2-激酶/果糖-2
6-二磷酸酶4
宫颈癌
生物信息学
诊断
预后
研究起点
研究来源
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研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
海南医学
半月刊
1003-6350
46-1025/R
大16开
海南省海口市海府路69号艺苑大厦702房
84-1
1973
chi
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