肺癌合并肺栓塞患者DNA甲基化基因的表达差异的分析研究

• 作者: 唐乐 李宏 牛海文 曹国磊 马荣辉 何丽丽 罗琴
• 来源期刊: 新疆医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 肺癌合并肺栓塞 癌症相关血栓 DNA甲基化 基因表达谱 联合分析 RNA测序 基因芯片
• 年，卷（期）: 2022,（1）
• 所属期刊栏目: 专题研究|Monographic Research
• 页码范围: 20-24
• 页数: 5页
• 分类号: R734
• 语种: 中文
• DOI: 10.3639/j.issn.1009-5551.2022.01.004

摘要

目的 GO富集分析联合KEGG通路分析筛选肺癌合并肺栓塞患者中参与肺栓塞形成的甲基化驱动基因.方法 以2019年1月—2019年12月新疆医科大学附属肿瘤医院呼吸内科收治的肺腺癌合并肺栓塞患者、肺腺癌患者各4例为研究对象,提取外周血总RNA及DNA,利用Illumina RNA高通量测序技术及Illumina 850K芯片甲基化检测平台测定转录组测序数据及DNA甲基化数据,通过差异表达基因及差异甲基化基因相关性分析筛选甲基化驱动基因,并通过KOBAS注释系统进行GO功能和KEGG通路分析.结果 肺癌合并肺栓组相对于肺癌组中筛选得到14个甲基化驱动基因为CD177、RNASE1、GMPR、NTN4、HIST1H2BM、SMIM5、MARCH2、CMBL、LGALS3、NME4、KIR2DL1、RNASE1 ANKRD9、SPTB,对应基因的差异表达log2FC值分别为2.594、3.666、1.946、-2.748、1.859、1.512、1.352、2.327、2.027、1.076、2.438、3.666、2.106、2.198.这些甲基化驱动基因通过自然杀伤细胞抑制、免疫突触形成、层粘连蛋白结合、细胞外基质结合等分子功能及核苷酸代谢、自然杀伤细胞介导的细胞毒作用、移植物抗宿主病抗原处理和提呈、轴突引导等通路参与肺癌相关肺栓的发生.结论 显著下调的NTN4和显著上调的RNASE1或参与肺癌患者肺栓塞的发生.