枳GRAS基因家族鉴定及其对低温胁迫的响应

• 作者: 杨杰 陈蓉 胡文娟 吴巧玲 佟晓楠 李兴涛
• 来源期刊: 植物生理学报
• 关键词: 枳 GRAS 基因家族 进化分析 表达模式
• 年，卷（期）: 2022,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告|Original Papers
• 页码范围: 130-140
• 页数: 11页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13592/j.cnki.ppj.2021.0290

摘要

本研究基于枳(Poncirus trifoliata)基因组数据,利用生物信息学方法鉴定了枳GRS基因家族成员,分析了其理化性质、染色体定位、基因结构、保守基序、进化关系和顺式作用元件,并通过实时荧光定量PCR (qRT-PCR)方法检测了PtrGRAS家族成员在低温胁迫下的相对表达量.结果 表明:在枳基因组中共鉴定出30个GRAS基因,分布在8条染色体上,氨基酸长度范围为441～833 aa,外显子数为1或2,其蛋白序列都具有保守的GRAS结构域;除PtrGRAS3、PtrG RAS11和PtrGRAS30外,其余PtrGRAS基因均分布于细胞核;系统进化分析将30个PtrGRAS基因分成10个亚族;顺式作用元件预测分析得到12个含有低温响应元件的PtrGRAS基因.qRT-PCR数据表明,12个PtrGRAS基因在低温胁迫下的相对表达量与对照相比存在显著差异,其中,PtrGRAS11、PtrGRAS26和PtrGRAS30受到低温胁迫的强烈诱导,这3个基因的表达量在处理各时期均显著上调.推测PtrGRAS家族成员在抵抗低温胁迫中发挥重要作用.