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甘草CHS基因家族鉴定、表达特性分析及其与甘草查尔酮A积累的关系研究
甘草CHS基因家族鉴定、表达特性分析及其与甘草查尔酮A积累的关系研究
作者:
何梦媛
姚华
李国治
杨茂
沈海涛
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
甘草
甘草查尔酮A
GuCHS
基因家族鉴定
生物信息学分析
摘要:
查尔酮合成酶(CHS)是植物黄酮类化合物合成途径中的关键限速酶,与植物类黄酮化合物的合成有密切关系.为了解甘草(Glycyrrhiza uralensis) CHS基因家族与甘草查尔酮A(licochalcone A)合成、积累的关系,本文研究了非生物胁迫下不同时间的甘草不同部位中甘草查尔酮A含量,进行了CHS基因家族表达特性和生物信息学分析.结果 显示,甘草查尔酮A主要在甘草地下部分中积累,非生物胁迫明显提升地下部分甘草查尔酮A含量,其在盐胁迫处理6h组的含量是对照组(O h组)的2.41倍,而在聚乙二醇(PEG)胁迫2h组的含量是对照组的1.76倍.基于对上述材料的转录组测序数据分析结果,发现有20个序列注释为CHS基因.其中,有14个GuCHS基因具有完整的读码框,且这些CH基因具有时空表达差异性.非生物胁迫诱导地下部分中的GuCHS基因上调,GuCHS1、GuCHS4和GuCHS5经胁迫诱导后表达量最高分别为对照的31.3倍、25倍和35倍,在处理2h组和12h组上调最为明显,而GuCHS2仅在PEG胁迫下明显上调,表达量变化趋势与甘草查尔酮A含量变化趋势相似.14个GuCHS基因的生物信息学分析显示,GuCHS1、GuCHS2、GuCHS4和GuCHS5较其他GuCH基因的启动子区域包含更多的G-box元件、MYC结合位点,故推测胁迫处理诱导茉莉酸、脱落酸等应激响应因子合成,调控地下部分GuCHS1、GuCHS2、GuCHS4和GuCHS5表达,提升甘草中甘草查尔酮A含量.本研究结果为优化甘草栽培体系、提升栽培甘草品质、探究GuCHS基因在甘草中的功能以及对甘草查尔酮A合成及调控机制提供研究基础.
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文献信息
篇名
甘草CHS基因家族鉴定、表达特性分析及其与甘草查尔酮A积累的关系研究
来源期刊
植物生理学报
学科
关键词
甘草
甘草查尔酮A
GuCHS
基因家族鉴定
生物信息学分析
年,卷(期)
2022,(1)
所属期刊栏目
研究报告|Original Papers
研究方向
页码范围
141-154
页数
14页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.13592/j.cnki.ppj.2021.0349
五维指标
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
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(0)
共引文献
(0)
参考文献
(0)
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(0)
二级引证文献
(0)
2022(0)
参考文献(0)
二级参考文献(0)
引证文献(0)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
甘草
甘草查尔酮A
GuCHS
基因家族鉴定
生物信息学分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
植物生理学报
主办单位:
中国植物生理学会
中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所
出版周期:
月刊
ISSN:
2095-1108
CN:
31-2055/Q
开本:
大16开
出版地:
上海市岳阳路319号31B楼
邮发代号:
4-267
创刊时间:
1951
语种:
chi
出版文献量(篇)
5646
总下载数(次)
4
总被引数(次)
80526
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